значения слов со временем претерпевают достаточно серьезные изменения - так что не надо все принимать буквально
к примеру "товарищ министра" в те времена обозначало просто замминистра, а вовсе не лучшего кореша чиновника

так и слово "черезвычайная" частенько означало "временная" или типа единоразовая или кратковременная- тут даже точно смысл трудно и передать
а свое время тогда живущие черезвычайным отнюдь не считали - сложным, серьезным,переломным скорее.
потому и коммисию назвали типа временной ибо надеялись быстро сломить сопротивление немногочисленных "темных сил" и пойти к светлому будущему... рука об руку... - по крайней мере на первом этапе в этом реально были уверены (может и не все но большинство однозначно)
не думаете же вы что люди сознательно и планомерно строили механизмы подавления и террора из расчета на годы и десятилетия?